Le zebre si riproducono sessualmente: la zebra maschio, che è chiamata stallone, monta una zebra femmina, che viene chiamata cavalla, e deposita lo sperma nella vagina della cavalla attraverso il pene dello stallone. Se l'accoppiamento ha successo, la cavalla fa nascere un solo puledro 12-13 mesi dopo.
Le mandrie di zebre sono in genere costituite da uno stallone e da diverse fattrici, comprendenti un gruppo noto come harem. Gli stalloni competono tra loro per rivendicare un harem. Una volta che uno stallone emerge vittorioso, la sua richiesta viene contestata solo quando altri stalloni percepiscono debolezza a causa di malattia o infortunio.
Gli stalloni raggiungono la maturità sessuale a 4 anni, mentre le giumente raggiungono la maturità sessuale tra i 2 e i 4 anni. Come altre specie equine, una zebra mare in estro - cioè in calore - spesso segnala la sua volontà di riprodursi con uno stallone "ammiccando" le labbra, o ruotandole verso l'esterno.
Il lungo periodo di gestazione osservato nelle zebre consente a un puledro di svilupparsi a sufficienza che, in pochi minuti dalla nascita, è in grado di reggersi. Nonostante questo vantaggio dello sviluppo, la mortalità infantile tra i puledri zebra è di circa il 50%. Se il puledro raggiunge la maturità, la vita media prevista in natura è tra 20 e 25 anni.