Il coyote mangia i pellicani, così come i gatti e gli esseri umani. Piccoli mammiferi e uccelli, come moffette, gabbiani e gatti selvatici cacciano i giovani pellicani. Gli umani sono anche predatori del pellicano, a caccia di loro per le piume e mangiando la carne.
I pellicani sono un grande uccello, che li rende più difficili da catturare per la maggior parte dei predatori nel loro ambiente naturale. Per questo motivo, la maggior parte degli animali non li caccia. Tuttavia, un pellicano ferito che non può volare è facile preda di cani selvatici, gatti selvatici e mammiferi più grandi.
Insieme alla caccia ai pellicani, anche gli umani hanno causato il declino della popolazione di pellicani con pesticidi, come il DDT. Questi pesticidi fanno sì che le uova dei pellicani rimangano sterili o nascondano pulcini danneggiati. Alcune specie di pellicani sono ancora in pericolo in Nord America.
