Molte specie di animali mangiano le api da miele, inclusi altri insetti, anfibi, uccelli e mammiferi. I mammiferi uccidono più api degli altri vertebrati, con orsi e tasso di miele che sono tra i più prolifici api. Diversi tipi di vespe e ragni si specializzano nelle api da caccia.
La predazione diretta non è l'unico modo in cui le api mellifere sono minacciate. Altre specie consumano le loro larve, il miele e persino la cera d'api dei loro alveari. Le larve di cera falena, i coleotteri dell'alveare e alcuni tipi di formiche possono vivere e nutrirsi all'interno dell'alveare. Alcune specie, come il più grande uccello del miele e il tasso di miele, lavorano insieme per trovare e distruggere gli alveari.