A partire dal 2014, la Lista Rossa dell'Unione Internazionale per la Conservazione della Natura e delle Risorse Naturali attribuisce agli ornitorinchi la classificazione di minore preoccupazione, il che significa che non sono in pericolo. Gli ornitorinchi sono state una specie protetta nel loro paese natale dell'Australia dal 1905 e rimangono comuni nell'Australia orientale. Le possibili minacce includono l'impigliamento nelle attrezzature da pesca e la perdita di habitat dovuta al degrado del flusso del fiume.
Gli ornitorinchi vivono in laghi, fiumi e torrenti in vari terreni dell'Australia orientale. Sfiorano il fondo del fiume e del lago per il cibo, come vermi, gamberetti e larve, e cacciano vicino alla superficie per pesci, rane e insetti. Scavano lunghe tane nelle rive del fiume per ripararsi. Il loro comportamento acquatico li rende vulnerabili ai cambiamenti nel normale flusso dei corsi d'acqua. La siccità, la regolazione umana dei corsi d'acqua e il sifonamento dell'acqua per usi industriali, agricoli e domestici minacciano gli habitat degli ornitorinchi. Le inondazioni dovute ai cicloni tropicali mettono anche in pericolo i loro habitat acquatici. Inoltre, l'inquinamento e le trappole che si insinuano nei corsi d'acqua per catturare crostacei e pesci rappresentano una potenziale minaccia per le popolazioni di ornitorinchi.
A parte il suo status ufficiale di animale protetto in Australia, gli sforzi di conservazione per gli ornitorinchi si concentrano sul mantenimento di popolazioni in un numero di santuari australiani. Sebbene siano stati fatti tentativi per esportare ornitorinchi negli zoo di altre parti del mondo, non sono sopravvissuti ben al di fuori dell'Australia.
