Generalmente i mammiferi terrestri, la maggior parte degli scoiattoli ha la capacità di nuotare nella paletta del cane. Usano la coda lunga e folta per sterzare, proprio come una barca usa un timone. In genere, vanno in acqua solo quando è necessario.
A causa delle ridotte dimensioni della maggior parte degli scoiattoli, non sono i più grandi nuotatori a distanza, e occasionalmente annegano se non raggiungono la riva in tempo. Anche se la maggior parte delle razze, come lo scoiattolo rosso e lo scoiattolo grigio orientale, sono in grado di nuotare, lo scoiattolo volante non può. I lembi extra che permettono agli scoiattoli volanti di planare nell'aria li ostacolano nell'acqua.
