I conigli selvatici portano malattie associate a parassiti e batteri, secondo la House Rabbit Society. È importante usare cautela quando si maneggiano conigli selvatici.
Una delle malattie più comuni trasportate dai conigli selvatici è la tularemia, nota anche come febbre da coniglio. La tularemia è una malattia batterica che può essere trasmessa agli esseri umani. Può essere contratto attraverso il contatto con il sangue o il tessuto di animali infetti. I cervi volano e le zecche possono anche trasmettere tularemia. I sintomi comprendono ulcere cutanee nel punto di infezione e linfonodi ingrossati.
I conigli possono anche portare la mixomatosi, un tipo di vaiolo che colpisce solo i conigli. La malattia di Calicivirus, nota anche come malattia emorragica del coniglio, è una malattia altamente contagiosa e fatale che colpisce esclusivamente i conigli selvatici e domestici.