Cleopatra divenne Faraone alla morte di suo padre. Nel suo testamento, Tolomeo XII lasciò la monarchia a Cleopatra, 17 anni, e suo fratello di 10 anni, Tolomeo XIII, e governarono l'Egitto insieme.
Cleopatra aveva sposato Tolomeo XIII quando aveva 12 anni perché non poteva governare senza un co-erede maschio. La tradizione tolemaica sosteneva che il sovrano era supremo e pretese che il suo nome fosse il primo. Tuttavia, tre anni dopo aver assunto il trono insieme, Cleopatra ha insistito affinché il suo nome, da solo, fosse messo su tutti i documenti ufficiali e che solo la sua immagine fosse messa sulle monete.
Tolomeo XIII vendicò mandando Cleopatra in esilio. Regnante da solo a 13 anni, Tolomeo cercò l'appoggio di Roma eseguendo uno dei nemici politici di Cesare, Pompeo. Mentre Pompeo era sposato con la figlia di Cesare, Cesare fu oltraggiato dall'omicidio e invase la capitale d'Egitto, facendosi mediatore tra gli interessi in competizione di Tolomeo e Cleopatra.
Facendo tesoro della rabbia di Cesare nei confronti di Tolomeo, Cleopatra si era arrotolata su un tappeto e introdotta di nascosto per incontrare Cesare. Divenne sua amante e diede alla luce suo figlio, e Cesare la aiutò a riconquistare il trono sconfiggendo l'esercito di Tolomeo; Tolomeo annegò nel Nilo e sposò il prossimo fratello in linea, Tolomeo XIV, come era consuetudine.
Dopo l'assassinio di Cesare, Cleopatra divenne l'amante di Marco Antonio. Quando l'Egitto cadde sotto il dominio romano, entrambi si suicidarono.
