Non tutte le tartarughe acquatiche possono respirare sott'acqua, ma alcune hanno sviluppato metodi per ottenere ossigeno sott'acqua. Alcuni prendono acqua attraverso il naso o la bocca e ottengono ossigeno attraverso i loro faringiti, mentre altri ne prendono acqua attraverso le loro aperture anali, secondo la Oceanic Resource Foundation.
L'ossigeno può essere assorbito attraverso la pelle alla gola o attraverso sacchi specializzati nell'area anale. C'è anche almeno una specie con strutture branchiali nell'area anale che aiutano a respirare sott'acqua. Le tartarughe possono trattenere il respiro per lunghi periodi di tempo, fino a tre ore in alcune specie, e possono gestire meglio il biossido di carbonio, riducendo la frequenza con cui hanno bisogno di respirare.
