La causa più comune delle macchie nere sul pesce rosso sono il trauma e l'irritazione a causa dei livelli elevati di ammoniaca nell'acqua. L'elevata ammoniaca brucia effettivamente le squame, causando macchie bianche. Le macchie nere appaiono mentre le scaglie iniziano a guarire.
Le ustioni da ammoniaca possono essere facilmente trattate rimuovendo l'ammoniaca in eccesso dall'acquario. Una volta che i livelli di ammoniaca sono in equilibrio, i cerotti bianchi iniziano a guarire, causando macchie nere. L'eccesso di ammoniaca si verifica quando il cibo non digerito inizia a decomporsi nella vasca dei pesci. Livelli elevati di ammoniaca sono comuni anche nelle vasche per pesci sovrappopolate, a causa dell'eccessivo spreco di pesce. I corretti cambi d'acqua e la pulizia del serbatoio possono aiutare a bilanciare i livelli di ammoniaca.
La malattia del punto nero è una malattia rara trasportata da lumache che sono state esposte agli escrementi di uccelli. Se le lumache infette vengono inserite inconsapevolmente nel serbatoio, possono passare la malattia sul pesce rosso. I parassiti scavano nelle squame e formano una cisti nera dura. La malattia del punto nero è relativamente innocua nei pesci rossi e in molti casi le cisti scompaiono da sole. Dal momento che non esiste un modo sicuro per sapere se le lumache stanno trasportando la malattia, il modo migliore per prevenire la malattia dei punti neri è tenere tutte le lumache fuori dall'acquario.
