Il Phylum Zoomastigina contiene organismi, come trichonympha e trypanosome, che hanno flagello e appartengono alla più ampia classe di protozoi. Questo phylum comprende molti organismi diversi, ma tutti hanno la caratteristica distinta di avere flagello , che sono lunghe estensioni a forma di frusta nelle loro alette che sembrano e funzionano come le code. Gli organismi in questo phylum sono eucarioti; sono privi di cloroplasti e possono vivere in molti ambienti diversi, compresa la superficie della Terra, sottoterra, nell'atmosfera e nell'acqua.
I flagellati e i tripanosomi sono tra gli organismi più comuni nel Phylum Zoomastigina. I flagellati sono organismi unicellulari ed eucarioti. Come con altre specie nel phylum, i flagellati hanno flagelli, ma queste estensioni si sviluppano quando i flagellati entrano nell'età adulta. I flagellati sono tra gli organismi più antichi e più abbondanti sulla Terra; sono primitivi nella composizione biologica e nell'aspetto esteriore. Sono abbondanti e vivono in molte aree, compresi i tratti digestivi di altri organismi, compresi i mammiferi e persino gli esseri umani. I flagellati sono eterotrofi e possono riprodursi sessualmente o asessualmente. I tripanosomi sono simili ai flagellati in apparenza, ma vivono quasi esclusivamente nei sistemi digestivi di topi e ratti. Questi organismi sono tra le più piccole specie di zoomastigina e sono generalmente benigni, a differenza dei flagellati e di altri zoomastiginas, che possono portare e produrre malattie e infezioni.