Mentre i difetti e le infezioni congenite contribuiscono alla morte prematura di quelli con microcefalia, molti vivono una durata media della vita, secondo Health Central. La Cleveland Clinic riporta anche un'aspettativa di vita inferiore, ma non indica un adeguamento significativo alla vita media.
Sebbene la microcefalia possa non essere una condanna a morte per un bambino o un bambino piccolo, spesso comporta gravi problemi di salute. L'ottantacinque percento di coloro che sono afflitti hanno un qualche livello di ritardo mentale o danno cerebrale, secondo la Cleveland Clinic. Sono comuni anche le convulsioni e il coordinamento fisico limitato. Le persone con microcefalia hanno anche bisogno di cure di salute mentale per affrontare le sfide di autostima a causa di caratteristiche fisiche anormali.