La funzione di caricamento del colorante nell'elettroforesi è di consentire al campione di DNA di affondare nei pozzetti del gel e di consentire agli scienziati di tracciare visivamente il campione di DNA mentre scorre attraverso il gel. elettroforesi su gel è un metodo utilizzato dagli scienziati per separare il DNA in fili di varie dimensioni. Il colorante di caricamento fa sì che il campione di DNA sia più denso del tampone di corsa.
La differenza di densità costringe il campione di DNA ad affondare nel fondo del pozzo e impedisce al campione di diffondersi nel buffer. Il caricamento dei coloranti consiste nel tracciare i coloranti che migrano con i campioni di DNA. Il glicerolo e il blu bromofenolo sono una miscela comune utilizzata per creare un tampone di caricamento. Il glicerolo si lega al DNA e lo rende più pesante, mentre il blu di bromofenolo macchia il DNA. Una soluzione di bromuro di etidio è generalmente utilizzata quando si esegue un'elettroforesi su gel. Il bromuro di etidio è una sostanza chimica che può essere vista sotto l'illuminazione ultravioletta. Il bromuro di etidio e altri coloranti fluorescenti si legano a campioni di DNA e si illuminano quando vengono posti in un transilluminatore. La quantità di colorante usata è cruciale quando si esegue l'elettroforesi su gel. Coloranti specifici sono correlati a determinate dimensioni di banda nei campioni di DNA. Un colorante troppo o troppo piccolo può oscurare le dimensioni del campione di DNA previsto.