"Three Skeleton Key" parla di tre uomini che lavorano in un faro su un'isola chiamata Three Skeleton Key. Si concentra su un incidente in cui una nave piena di topi si schianta sull'isola, e gli uomini devono combattere per rimanere in vita.
I tre uomini che lavorano al faro sono il narratore senza nome, Le Gleo e Itchoua. Individuano la nave abbandonata mentre si avvicina, e poi vedono i topi avvicinarsi. Questi ratti sono grandi e cattivi, e gli uomini suppongono che i ratti abbiano ucciso e mangiato l'equipaggio della nave.
Quando la nave si schianta sull'isola, gli uomini assicurano il faro per tenere fuori i topi. Trascorrono molti giorni e notti intrappolati, e sebbene abbiano rifornimenti, la prossima nave di rifornimento non è prevista per arrivare per settimane. Non sono in grado di segnalare aiuto, perché dovrebbero uscire.
Il sigillo su una finestra emette una notte, e gli uomini devono combattere l'orda di topi. Si chiudono nella stanza delle lanterne. Senza cibo o acqua, decidono di evitare di accendere la lanterna, che di solito è fatta solo se tutti i membri del faro sono morti.
Il loro piano alla fine porta alla loro salvezza, dopo che la guardia costiera aiuta a uccidere i topi. Tuttavia, l'incidente spinge Le Gleo alla follia e Itchoua muore a causa di un'infezione. Il narratore decide di continuare a lavorare al faro.