La temperatura, il livello di pH e le concentrazioni di enzima e substrato influenzano tutti la funzionalità degli enzimi. Gli inibitori chimici possono anche influenzare il modo in cui gli enzimi funzionano e riducono la loro efficacia.
La temperatura influenza l'energia cinetica di ogni data molecola. Le temperature più calde forniscono più energia cinetica, aumentando le probabilità di successo di collisioni molecolari. Al di sopra di una temperatura ottimale, la struttura dell'enzima inizia a decomporsi quando i legami molecolari si rompono e il potenziale catalitico di attività viene ridotto.
Come la temperatura, c'è anche un livello di pH ottimale per la funzionalità enzimatica. Le variazioni dei livelli di pH possono creare o distruggere legami molecolari, cambiando la forma degli enzimi e influenzando direttamente l'efficacia dell'enzima.
La velocità delle reazioni catalizzate dagli enzimi dipende dalle concentrazioni di enzima e substrato. La velocità della reazione aumenta al crescere della concentrazione di entrambi. Il tasso di aumento cresce finché il sito attivo non è saturo di substrato. Se la concentrazione del substrato è elevata e la temperatura e il pH sono mantenuti a un livello costante, la velocità di reazione è direttamente proporzionale alla concentrazione dell'enzima.
I prodotti chimici chiamati inibitori possono ridurre o addirittura arrestare l'attività catalitica dell'enzima. Gli inibitori attivi diretti al sito occupano il sito attivo e competono con il substrato per il sito attivo. Altri inibitori, chiamati inibitori diretti al sito non attivi, si attaccano alla struttura enzimatica e ne distorcono la forma.
