La home page PubMed fornisce informazioni sul numero di citazioni che ospita, nonché esempi dei tipi di letteratura che offre e da quale entità viene raccolta la letteratura. Sotto l'intestazione Utilizzo di PubMed ci sono collegamenti a una guida rapida, articoli completi, domande frequenti, tutorial e uno strumento di ricerca di prove cliniche. Ulteriori informazioni sulla home page includono l'indirizzo del National Center for Biotechnology Information, Biblioteca Nazionale di Medicina degli Stati Uniti.
Sotto l'intestazione PubMed Tools ci sono i collegamenti PubMed Mobile, Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries e Query specifiche per argomento. L'intestazione Ulteriori risorse offre collegamenti al database MeSH, ai periodici del database NCBI, ai programmi di utilità di programmazione Entrez e a LinkOut.
La voce Guida introduttiva nella parte inferiore della home page contiene collegamenti al National Center for Biotechnology Information education, un manuale di aiuto NCBI e un manuale NCBI. È inoltre disponibile un link per la formazione e i tutorial, così come un link per inviare dati.
Sotto l'intestazione Risorse, gli utenti trovano collegamenti dal titolo Prodotti chimici & Bioassay, dati e amp; Software, DNA e amp; RNA, domini e amp; Strutture e geni e amp; Espressioni. Genetica e amp; Medicina, genomi e amp; Mappe, omologia, letteratura e proteine sono collegamenti aggiuntivi.
La home page di PubMed offre un link per scrivere l'help desk in basso a destra. Un link di contatto si trova in basso a sinistra.