La maggior parte della massa di terra egiziana è un deserto piatto e informe che supporta solo una vegetazione minima. Nell'angolo orientale superiore del paese nordafricano, la penisola montuosa del Sinai confina con Israele ed è separata dal resto del continente africano dal canale di Suez. L'Egitto è un paese transcontinentale in cui l'Istmo di Suez funge da ponte di terra tra i continenti dell'Africa e dell'Asia.
Una delle caratteristiche principali dell'Egitto è il fiume Nilo e il suo delta. Senza il beneficio delle acque del fiume Nilo, l'Egitto potrebbe essere diventato vuoto come le altre regioni del Nord Africa coperte dal deserto del Sahara. Il Nilo è fiancheggiato da piane alluvionali che si allargano mentre il fiume scorre a nord verso il Mar Mediterraneo, alla fine si aprono a ventaglio per formare il delta del Nilo a nord del Cairo, la capitale della nazione. A causa delle condizioni aride del resto del paese, i centri abitati si trovano attorno alla stretta valle del Nilo e al delta del Nilo, con il 99% della popolazione che utilizza solo il 5,5% circa del territorio del paese.
La necropoli di Giza è la caratteristica fisica dell'uomo più iconica dell'Egitto, con le sue piramidi e la Grande Sfinge che rappresenta un'enorme attrazione turistica. Una caratteristica fisica molto più recente creata dall'uomo è il Canale di Suez, considerato il componente più importante del trasporto marittimo del Medio Oriente. Aperto alla spedizione nel 1869 dopo 10 anni di lavori di costruzione, l'idrovia artificiale dell'Egitto che attraversa l'istmo di Suez collega il Mar Mediterraneo con il Mar Rosso. Il Canale di Suez consente di effettuare il trasporto di navi tra l'Europa e l'Asia senza la necessità di navigare in Africa.