Battisti e presbiteriani hanno punti di vista diversi sulla pratica del battesimo. I battisti credono che la persona che viene battezzata deve professare la propria fede in Cristo prima di essere immersi nell'acqua, mentre i presbiteriani credono che le persone dovrebbero essere cosparse di l'acqua come immersione non è scritturale. I presbiteriani credono anche che i bambini possano essere battezzati, anche se non possono esprimere la loro fede. I battisti credono che le persone nascano nel peccato, quindi devono essere abbastanza grandi per pentirsi prima di essere battezzati.
Le chiese presbiteriane consentono alle persone che non sono state battezzate di prendere la comunione, anche se la persona non ha espresso alcuna fede. I battisti, d'altra parte, permettono solo alle persone che sono battezzate e hanno fede di prendere parte.
I battisti credono che ogni chiesa sia indipendente, mentre le chiese presbiteriane devono rispondere alle istanze ecclesiastiche legislative e giudiziarie. I membri delle congregazioni presbiteriane possono appellarsi al presbiterio se sono preoccupati per la cattiva gestione o qualsiasi altra questione, mentre le chiese battiste non hanno questa disposizione.
I preti presbiteriani devono avere una laurea o altra prova di educazione prima di poter essere ordinati. Il presbiterio controlla anche la conoscenza del prete di ebraico e greco, insieme a filosofia, etica e governo ecclesiastico. I battisti credono che una persona non richieda un corso di studi per diventare sacerdote; invece, credono che Dio chiama gli uomini al ministero e che la conoscenza del Vangelo e il desiderio di salvare le anime sono tutto ciò che è richiesto.
