Il principale svantaggio dei pacchetti integrati è che sono meno potenti rispetto alle applicazioni stand alone. In genere hanno meno funzionalità rispetto alle controparti dei pacchetti per scopi generali.
Poiché tutte le applicazioni all'interno del pacchetto vengono caricate da un singolo avvio, verranno caricate simultaneamente nella memoria, anche se l'attività eseguita è semplice e non richiede molta potenza di calcolo.
Nonostante i loro difetti, i pacchetti integrati sono generalmente più economici di programmi separati. Tutte le applicazioni in un pacchetto software integrato di solito hanno un'interfaccia grafica simile, questo rende il passaggio tra un'applicazione semplice e senza interruzioni.
