La maggior parte degli svantaggi dell'utilizzo di una rete di computer, al contrario di un computer autonomo, ruota attorno alla complessità di tali reti e al loro costo. Mentre ci sono molti indiscutibili vantaggi per il networking di computer, le reti creano anche una serie di svantaggi.
I costi associati alle reti di computer possono essere considerevoli. La configurazione iniziale può essere costosa, comportando l'installazione di cavi o tecnologia wireless per consentire la comunicazione tra postazioni computer. Una volta che la rete è attiva e funzionante, in genere richiede il servizio dedicato di almeno un dipendente insieme a una formazione specializzata per altri membri dello staff al fine di utilizzarlo.
Uno dei grandi vantaggi del networking è che i programmi e i file possono essere facilmente condivisi, ma la stessa facilità significa che se il server non funziona, nessuno sulla rete può funzionare. I virus possono anche diffondersi rapidamente attraverso una rete.
La velocità e l'efficienza complessive della rete sono influenzate dal numero di utenti registrati in qualsiasi momento, dal tipo di lavoro che stanno facendo e dal tipo di file che stanno salvando. La rete rallenta con più utenti su di esso. Se le persone guardano video, ascoltano musica o manipolano file di grandi dimensioni, possono anche rallentare la rete per tutti. Il salvataggio di file di grandi dimensioni può anche creare una carenza di spazio di archiviazione.