Oltre agli umani, i nemici della balena blu sono orche e squali. Le balene azzurre adulte sono molto più grandi di ogni singola balena o squalo assassino, quindi questi animali tendono ad attaccare i vitelli. Poche creature sono in grado di sottomettere una sana balena blu adulta, che è la più grande creatura sulla terra. Le balene blu si nutrono principalmente di krill.
Dato che i vitelli di balena blu stanno vicino alle loro madri, la strategia del branco di balene killer è di molestare la madre e il vitello fino a quando non sono esausti. Le orche poi isolano il vitello e impediscono che affiorino per respirare fino a quando il vitello annega. Tuttavia, ci sono stati casi in cui le balene azzurre adulte sono state gravemente ferite da attacchi di orche. Le orche possono inseguire una balena blu per ore, circondarla e persino saltare sulla schiena per sconfiggerla. Per tutto il tempo, i membri del pod mordono i pezzi dalla balena per indebolirla.
Un grande squalo bianco potrebbe avvicinarsi a un vitello di balena blu da dietro o sotto per evitare il rilevamento. Gli squali molto grandi che sono 13 piedi o più tendono a bersagliare i mammiferi marini, come le balene blu, a causa dell'alimentazione che si ha dal loro grasso.
