I paesi limitrofi del Giappone sono Corea del Sud, Corea del Nord, Russia e Cina. Il Giappone è una nazione arcipelagica situata nell'Asia orientale e circondata dall'Oceano Pacifico settentrionale e dal Mar del Giappone.
Le quattro isole principali del Giappone sono Honshu, Kyushu, Hokkaido e Shikoku. La penisola coreana si trova a circa 124 miglia di distanza dall'isola di Kyushu, mentre la costa russa è separata da 186 miglia dall'isola di Hokkaido, anche se l'isola russa di Shakhalin si trova a soli 23 miglia al largo del Giappone. Il terreno del Giappone è prevalentemente montuoso con frequenti eventi sismici a causa dei numerosi vulcani attivi che circondano il paese.