I minerali sono formati da processi organici, cristallizzazione, fusione e trasformazioni cristallografiche che si verificano nello stato solido del minerale. Le trasformazioni cristallografiche si verificano generalmente con una variazione della pressione o della temperatura nel materiale che circonda il deposito di minerali .
I minerali a volte si formano a causa dei loro componenti molecolari, come il calcio, che vengono assorbiti dagli esseri viventi. Un esempio di questo sarebbe coccolithophores che incorpora carbonato di calcio nei loro scheletri. I minerali a volte si formano riunendosi in liquido per formare cristalli. Nuovi minerali possono anche essere sintetizzati all'interno di una roccia ignea di raffreddamento. La maggior parte dei minerali trovati sulla crosta terrestre si sono formati in questo modo.