In totale, il Giappone ha 6.852 isole. Tuttavia, questa definizione include solo isole con circonferenza di 100 metri o più grandi; una definizione meno restrittiva porterebbe a un conteggio molto più alto, mentre una più restrittiva porterebbe ad un conteggio inferiore. Solo 430 isole giapponesi sono abitate.
La maggior parte delle persone in Giappone vive su quattro isole: Hokkaido, Honshu, Shikoku e Kyushu. Di questi, Honshu è il più grande e il più popoloso con un ampio margine; è anche la settima isola più grande del mondo, con una lunghezza totale di 810 miglia. Una delle più piccole isole del Giappone, Aogashima, aveva una popolazione di solo 205 persone nel 2009, di cui 25 studenti.
