Le aquile calve possono deporre fino a cinque uova, sebbene le frizioni da uno a tre uova siano molto più comuni; queste uova hanno in genere un successo misto, con l'aquila media che termina con una covata di circa due pulcini. Tuttavia, in alcune località, sono stati segnalati alti tassi di successo della schiusa, con conseguente covata di tre o quattro pulcini di aquila calva . Le coppie di aquile calve nidificano a tenere sempre sotto controllo le loro uova a causa del rischio di incursioni da parte di predatori nidificanti come scoiattoli e uccelli predatori tra cui corvi e gabbiani.
Le uova di aquila calva sono relativamente grandi per le uova di uccelli e sono paragonabili per dimensioni a una palla da baseball. Queste uova sono abbastanza robuste da sopportare il peso di un'aquila calva adulta, e di solito sono di colore biancastro o biancastro. Gli adulti devono sedersi sulle uova non solo per allontanare i predatori ma anche per mantenere le uova abbastanza calde da rimanere vitali. In alcuni casi, gli eventi meteorologici lo rendono impossibile, e anche i genitori più diligenti dell'aquila calva possono ritrovarsi con uova non vitali dopo uno schiocco di freddo. Le uova vengono incubate per poco più di un mese prima che si verifichi la schiusa e sia le aquile che le femmine condividono la responsabilità di tenere le uova al sicuro e al caldo.
