Dal 2014, in natura vivono da 177.000 a 300.000 scimpanzé. La popolazione degli scimpanzé sta diminuendo man mano che l'attività umana degrada il loro habitat primario nell'Africa equatoriale.
Gli scimpanzè sono considerati una specie in via di estinzione. Le comunità da 15 a 150 sono disseminate nelle foreste dell'Africa tropicale, con la maggior quantità di risorse nella Repubblica Democratica del Congo.
Gli umani impiegano spesso tattiche di taglio e bruciatura per eliminare grandi porzioni di terra per l'agricoltura o l'allevamento. Le strade analizzano parti delle foreste, consentendo a minatori e boscaioli di scavare più a fondo negli habitat degli scimpanzé. I bracconieri spesso cacciano gli scimpanzé per venderli come carne, animali domestici o soggetti del test.
La malattia è un altro fattore importante nell'aumento del tasso di mortalità degli scimpanzé. Sono così geneticamente simili agli umani che molte malattie sono trasmissibili tra le specie, come l'Ebola.
Intorno al 1960, la popolazione di scimpanzé contava più di 1 milione.
