Tutti i pipistrelli possono vedere. Le specie di Microbat hanno generalmente occhi poco sviluppati e scarsa acuità visiva, ma la maggior parte delle specie di megabat ha una vista eccellente e persino una certa visione dei colori.
Alcuni pipistrelli usano l'ecolocalizzazione per catturare la preda. I pipistrelli emettono grida ultrasoniche che rimbalzano su di loro, permettendo al pipistrello di ottenere un'immagine dei suoi dintorni. I pipistrelli che usano l'ecolocazione tendono ad avere una visione peggiore, ma usano i loro occhi per navigare oltre la gamma della loro ecolocalizzazione. I pipistrelli notturni e delle caverne si sono adattati per poter usare una luce molto fioca, e alcune specie potrebbero persino essere in grado di vedere la luce ultravioletta.