La razza con cui è mescolato un Chihuahua è sconosciuta. Ci sono molte idee sull'origine della razza, ma non ci sono prove che siano vere.
Alcuni credono che la razza provenga dalla regione del Sud e Centro America e sia stata sviluppata attraverso l'allevamento del cane Techichi. Altri credono che il Chihuahua sia originario della Cina e sia stato importato negli Stati Uniti dove è stato allevato con piccoli cani nativi. Altri ancora credono che la razza fosse derivata dalla volpe Fennec, originaria del Sudafrica.
Anche con la prova che i Chihuahua esistono da tempi remoti, si dice che abbia avuto origine in Messico e sia stato chiamato per lo stato di Chihuahua situato in quel paese.
