Il sistema dello stoppino è uno dei più semplici e basilari di tutti i sistemi idroponici. Non ha parti mobili e richiede un serbatoio per la soluzione idroponica, un vassoio di crescita per supportare le piante e stoppini . Gli stoppini comuni sono corda di cotone o nylon. Pur non costosi, i sistemi di stoppino non funzionano bene per le piante di grandi dimensioni che richiedono grandi quantità di acqua, come i pomodori.
Con il sistema dello stoppino, l'intero vassoio di crescita è pieno di terreno di coltura. In altri sistemi, i vassoi usano spesso vasi a rete per contenere il materiale, che consente di assorbire acqua e sostanze nutritive mentre i livelli dell'acqua diminuiscono e fluiscono. Con il sistema dello stoppino, i supporti in crescita devono fornire un'azione capillare per l'assorbimento senza compattare. Miscele fuori suolo, perlite o vermiculite sono buone scelte.
Il sistema dello stoppino mantiene le radici costantemente bagnate. Ciò significa che la soluzione nutritiva richiede aerazione, spesso eseguita utilizzando una pompa per acquario e una pietra per aria. L'aerazione della soluzione fornisce l'ossigeno che le radici normalmente assorbirebbero durante i cicli secchi di altri sistemi idroponici.
Gli stoppini trasportano i nutrienti dal serbatoio al vassoio di crescita. La corda di cotone è economica ed efficace, ma marcisce e cola nel tempo. La fune di nylon non è soggetta né a marciume né a muffa. I sistemi richiedono generalmente uno stoppino per pianta, con la parte superiore dello stoppino vicino al bulbo.