Gli animali che vivono in Francia come specie autoctone includono cervi rossi, stambecchi, genette, muskrats, lontre, conigli, marmotte alpine, linci, castori, puzzole, tassi, cavalli selvaggi della Camargue, ragondini e volpi. Le specie protette includono le faine, gli albanella, gli scoiattoli rossi, i camosci, i cinghiali e i falchi pellegrini. La Francia ha molte aree ancora selvagge, con habitat naturali per i suoi animali.
La vasta gamma di habitat naturali della Francia consente di supportare una varietà altrettanto ampia di animali. Lo stambecco è originario delle regioni alpine della Francia; è riconoscibile dalle lunghe corna che si piegano all'indietro dietro la testa. I geneti furono introdotti in Francia dall'Africa nel sesto secolo e furono originariamente addestrati a catturare i roditori, come i furetti sono in tempi moderni. Muskrats è venuto in Francia dal Sud America come parte del movimento di allevamento di pellicce. Inoltre, i criceti selvatici vivono nella valle del Reno.
Sebbene orsi bruni e lupi fossero minacciati in Francia, gli orsi bruni sono stati reintrodotti nei Pirenei e nei lupi delle Alpi, in particolare nel Parco Nazionale del Mercantour. I castori sono stati reintrodotti nella Valle del Rodano dopo essersi quasi estinti in Francia. Gli scoiattoli rossi sono protetti in tutta Europa e sono più comuni in Francia che in altri paesi. Il camoscio, una capra di montagna che vive nelle Alpi, è considerato uno degli animali emblematici delle Alpi.