L'Alabama ha un gran numero di specie autoctone, tra cui cinghiali, cervi dalla coda bianca, linci rosse, volpi rosse e grigie, coyote, lontre di fiume del Nord America, puzzole, procioni, opossum e armadilli. L'Alabama è anche sede di una popolazione diversificata di uccelli, insetti e rettili.
Alcune specie che furono trovate in Alabama furono cacciate dallo stato, come l'alce, il bisonte, il lupo rosso e il puma. Alcune altre specie, come l'orso nero, si trovano ancora lì a partire dal 2014, ma in piccoli numeri. Ci sono stati anche avvistamenti non confermati del jaguarundi, un piccolo gatto simile a una lontra. Durante l'estate, il lamantino in via di estinzione può essere trovato nelle acque costiere. Il parrocchetto della Carolina è stato trovato in tutta l'Alabama ma è stato portato all'estinzione dalla perdita di habitat.
L'Alabama è anche conosciuta per la sua pesca sportiva, in particolare per il suo pesce gatto e gambero. Centoquarantotto diverse specie di uccelli si riproducono regolarmente in Alabama, mentre in inverno vi abitano altre 174 specie. Questi includono tacchini selvatici, rapaci, come gheppi e falchi, uccelli costieri, picchi e svassi. Lo stato ha anche 62 specie di mammiferi e 93 specie di rettili, tra cui l'alligatore americano nelle parti meridionali dello stato. Si ritiene che il serpente indaco orientale sia stato estirpato dall'Alabama ma è stato reintrodotto a partire dal 2010.
