I pesci hanno un sistema digestivo che inizia dalla bocca e finisce nell'ano. Di solito è composto da bocca, esofago, stomaco, pancreas e intestino. Tuttavia, non tutte le specie di pesci hanno uno stomaco, come i Ciprinidine e i Ciprinidi, e i pesci erbivori hanno tratti digestivi più lunghi rispetto ai pesci carnivori.
Il cibo viene introdotto nel corpo attraverso la bocca e poi nella faringe dove viene macinato con denti faringei prima di entrare nell'esofago. Strutturato con muscoli, le pareti dell'esofago possono espandersi per accogliere oggetti di grandi dimensioni. Il cibo viene poi decomposto nello stomaco dalle sostanze rilasciate dalle ghiandole gastriche. Alcune specie di pesci hanno un ventriglio all'inizio dello stomaco che inizia il processo digestivo. Il caeca pilorico si trova all'estremità dello stomaco in molte specie di pesci e questi continuano il processo digestivo ed espandono l'intestino. La digestione è aiutata dalla secrezione di enzimi dal pancreas all'intestino dove si verifica la maggior parte dell'assorbimento di cibo. Le feci lasciano il corpo attraverso l'ano.
