Il monte Fuji, la montagna più alta del Giappone, era formato da una serie di eruzioni vulcaniche avvenute negli ultimi 100.000 anni. I geologi identificarono quattro fasi principali dell'eruzione vulcanica nel processo di formazione del monte Fuji. Queste fasi hanno depositato strati di roccia basaltica e andesite nella montagna. Il vulcano è ancora attivo, con la più recente eruzione del 1707.
Gli strati più profondi del Monte Fuji erano formati da diversi vecchi vulcani chiamati Komitake e Ko-Fuji. Questi vulcani erano attivi fino a circa 10.000 anni fa. Le forme dei due vulcani sottostanti contribuiscono all'irregolarità della forma attuale del vulcano. Komitake e Ko-Fuji divennero inattivi quando grandi flussi di lava iniziarono ad emergere dal vulcano attualmente attivo. Questo vulcano, noto come New Fuji, ha depositato una grande quantità di roccia basaltica sui vecchi vulcani.
La maggior parte delle eruzioni si sono verificate tra 3.000 e 4.500 anni fa. L'ultima eruzione di Fuji nel 1707 fu la più grande nella storia, e avvenne alla cima del vulcano. Più di 100 piccoli vulcani a cono si trovano sui fianchi della montagna, ma sono molto meno attivi. A partire dal 2000 ci fu preoccupazione che il vulcano del monte Fuji si stesse risvegliando e sarebbe esploso di nuovo, ma un'eruzione del 21 ° secolo deve ancora verificarsi.