I leoni marini sono minacciati principalmente da orche e squali e, con pochi meccanismi di difesa naturali, cercano di sfuggire a questi predatori uscendo dall'acqua e atterrando il più rapidamente possibile. Leoni marini sono più veloci nuotatori di entrambi i loro predatori naturali e, se sani, pienamente cresciuti e consapevoli della minaccia, possono sfuggire a loro con facilità.
Molto più pericolosi per i leoni marini che le orche e gli squali, tuttavia, sono umani. La gente caccia i leoni marini per cibo, grasso, olio e pelliccia. Gli animali vengono anche uccisi per impedire loro di competere con i pescatori che non vogliono solo preservare le loro catture ma vogliono proteggere le loro reti da pesca dal danno provocato dai leoni marini. Durante la fine del 1800, i governi hanno permesso alle persone di uccidere i leoni marini per una taglia come metodo di controllo della popolazione.
I leoni marini non hanno difese contro gli umani e la loro popolazione è in aumento solo grazie agli sforzi dei gruppi di conservazione che lavorano con vari governi per approvare leggi che li proteggano. Queste leggi non sono comunque in tutto il mondo. In termini di stato di conservazione, i leoni marini sono descritti come vulnerabili, con piani di recupero redatti e pronti per essere implementati. A partire dal 2014, le interazioni con le operazioni di pesca commerciali, l'intrico in detriti e reti, fuoriuscite di petrolio e disturbi umani continuano a danneggiare le popolazioni di leoni marini.
