A causa dei loro gusci duri e pelli spesse, le tartarughe del deserto adulti sono prede solo dei leoni di montagna. Le giovani tartarughe del deserto sono molto più vulnerabili e vengono mangiate anche da volpi kit, coyote, cani selvatici, volpi grigie, linci, tassi, corvi, roadrunner e mostri Gila.
Le tartarughe del deserto femminile proteggono le loro uova vulnerabili per un po ', ma una volta che si schiudono, le giovani tartarughe devono fare affidamento sulla loro criptica colorazione per sopravvivere. Le tartarughe del deserto si rifugiano nelle tane quando non cercano cibo o compagni e sono esperti scavatori. Come ultima risorsa, le tartarughe del deserto di tutte le età urinano a rendersi meno appetibili ai potenziali predatori.