La posizione assoluta di Tokyo, in Giappone, si trova alla latitudine di 35 gradi e 41 minuti a nord e di 139 gradi a 41 minuti a est. Tokyo si trova intorno alla parte centrale dell'arcipelago giapponese, a sud del distretto di Kanto a Honshu, l'isola principale del paese.
Tokyo condivide un confine con quattro distretti amministrativi, ovvero la prefettura di Saitama, la prefettura di Chiba, la prefettura di Yamanashi e la prefettura di Kanagawa. Tokyo, Chiba, Kanagawa e Saitama comprendono la Tokyo Megalopolis Region, con altre quattro prefetture, Gunma, Yamanashi, Ibaraki e Tochigi che costituiscono la National Capital Region. Tokyo rimane il centro tecnologico e commerciale nella regione del Kanto in Giappone.