Il glicogeno si trova principalmente nel fegato e nei muscoli scheletrici del corpo umano. Il National Center for Biotechnology Information riporta che il fegato ha una concentrazione di glicogeno del 10% in peso, rispetto a un 2 concentrazione percentuale nei muscoli scheletrici. Tuttavia, i muscoli scheletrici contengono la maggior parte del glicogeno nel corpo a causa della loro massa complessiva.
Il glicogeno è una forma di accumulo di glucosio che il corpo può facilmente metabolizzare per fornire il glucosio richiesto per produrre energia. Consistenti quantità di glucosio sono immagazzinate sotto forma di glicogeno e non di grasso, per una facile conversione in glucosio per la fornitura di energia tra i pasti. Il glicogeno è quindi una riserva di glucosio nonché un mezzo per il corpo umano per mantenere l'equilibrio nei livelli di glucosio nel sangue.
Il corpo può metabolizzare prontamente il glicogeno, anche in assenza di ossigeno, il che rende il glicogeno un'importante fonte di energia durante attività intense o improvvise. Il glicogeno immagazzinato nei muscoli è suddiviso dalle cellule muscolari per l'uso all'interno dei muscoli, mentre il glicogeno immagazzinato nel fegato è suddiviso per l'uso nel resto del corpo, incluso il sistema nervoso. Al contrario, l'energia immagazzinata sotto forma di grasso non è facilmente disponibile. Le quantità di glicogeno immagazzinate nei muscoli, nel fegato e nei globuli rossi dipendono dall'allenamento del corpo, dal suo metabolismo basale e dalle abitudini alimentari dell'individuo.