L'ibuprofene è relativamente non polare. Questo perché ha gruppi alchilici non polari e un anello benzenico che riduce la polarità complessiva della molecola apportata dal suo gruppo carbossilico. Pertanto, l'ibuprofene è solo leggermente solubile in acqua, sciogliendo 21 milligrammi solo per litro di acqua a 25 gradi Celsius.
La proprietà non polare dell'ibuprofene lo rende molto solubile nell'alcol e nella maggior parte dei solventi organici. Al fine di rendere l'ibuprofene più solubile e più veloce, può essere miscelato con il sale di lisina. Rendere l'ibuprofene in un gel e miscelarlo con un solvente come il 2-propanolo, che ha una maggiore polarità, rende più facile l'assorbimento attraverso lo strato interno polare della pelle.