Louis Pasteur alla fine confutò la generazione spontanea attraverso un esperimento in cui il brodo di carne veniva sterilizzato attraverso l'ebollizione in due fiasche, una che era esposta all'aria e un'altra che era protetta da essa. Quello che era esposto a i contaminanti si sono annebbiati, mostrando una crescita microbica, mentre quello sigillato no.
Louis Pasteur è famoso per i suoi contributi alla comprensione della malattia e dei microbi in generale. Il processo di pastorizzazione, in cui latte, vino e altri materiali di consumo sono trattati per fermare la contaminazione batterica, è stato scoperto e nominato per lui. Pasteur è stato il primo a dimostrare che la fermentazione è causata da microrganismi e che l'ossigeno non è richiesto per questo processo.
Pasteur non ha originato la teoria dei germi, ma è stato lui a fornire prove sperimentali sufficienti a convincere la maggior parte della comunità scientifica che era vero. Fu anche il primo a enunciare i principi della vaccinazione e creò i primi vaccini contro la rabbia e l'antrace. Ha scoperto questi principi dopo un incidente mentre studiava il colera del pollo, normalmente una malattia mortale. Trattava i polli con una coltura batterica che si era guastata, producendo solo sintomi lievi. In seguito, non è riuscito a reinfettare i polli, anche con batteri vitali.
