Il mesoderma extraembrionale è un mesoderma dell'utero che non fa parte dell'embrione stesso. Questi includono il mesoderma nell'amnione, nel corion, nel sacco vitellino e nel gambo di collegamento. Il mesoderma si trova nel mezzo di tre strati germinali primari dell'embrione. Il mesoderma embrionale si forma dall'ipoblasto (anche il contributo del trofoblasto è probabile), mentre nei topi, questo deriva dall'estremità caudale della striscia primitiva.
L'impianto di blastocisti nell'endometrio dell'utero è completato nella seconda settimana dello sviluppo. Embryoblast (le cellule della massa) si differenziano in due strati; questi sono strati di ipoblasti e epiblasti. Lo strato di ipoblasto è costituito da minuscole cellule cuboidali, mentre lo strato epiblastico è costituito da cellule altamente colonnari. La differenziazione dei due nell'embrione forma un disco embrionale.
La membrana esocoelomica e l'ipoblasto formano il rivestimento della cavità esocoelomica (sacco vitellino primitivo). Il mesoderma extraembrionico è formato dalle cellule derivate dal sacco vitellino e occupa lo spazio tra il trofoblasto dall'esterno e la membrana esocoelomica e l'amnione dall'interno. Una grande quantità di eventi all'interno del mesoderma extraembrionale differenzia il mesoderma extraembrionale in due strati: il mesoderma somatico extraembrionale e il mesoderma splancnico extraembrionale. La parte extraembrionale dell'ectoderma e il mesoderma somatico extraembrionale formano l'amnione.