Secondo Nature.com, l'aquila reale è in cima alla catena alimentare, sopra piante, scoiattoli e scorpioni. Le piante sono considerate produttori primari e costituiscono il primo livello della catena alimentare . Gli scoiattoli di terra, che sono i principali consumatori, sono al secondo livello e si nutrono di piante. Le aquile reali sono consumatori terziari, il che significa che predano consumatori primari e secondari.
Le aquile reali catturano i piccoli mammiferi che costituiscono il gruppo di consumatori primari, come conigli, marmotte e marmotte. Si nutrono anche di cervi, capre di montagna, pecore bighorn e pronghorn, che si nutrono di erba e piante. Sebbene questi animali siano consumatori primari, sono molto più grandi dei piccoli mammiferi e delle aquile reali. Le aquile reali mangiano una grande varietà di animali, come rettili, pesci, uccelli e insetti. Sono anche una minaccia per gli animali da fattoria. Questi uccelli occasionalmente uccidono e mangiano anche sigilli e tassi. In alcuni rari casi, le aquile reali hanno ucciso e mangiato altri predatori come coyote e linci rosse. In un modello di catena alimentare che include i coyote come la preda dell'aquila reale, la catena inizia con piante o "autotrofi". Il principale gruppo di consumatori comprende cavallette, topi e scoiattoli. I coyote prendono il loro posto al terzo livello, come consumatori secondari, e l'aquila reale regna come il consumatore terziario.