Gli enzimi sono classificati in sei tipi: ossidoriduttasi, transferasi, idrolasi, liasi, isomerasi e ligasi. La classificazione degli enzimi si basa sulla reazione chimica catalizzata dall'enzima.
Gli enzimi classificati come ossidoriduttasi svolgono reazioni di ossidazione e riduzione, per cui un substrato viene ossidato e un altro viene ridotto. Le transferasi spostano gruppi funzionali da una molecola all'altra. Le idrolasi rompono i legami singoli tra gli atomi aggiungendo una molecola d'acqua. Lyasi trasferisce gruppi amminici, acqua o ammoniaca per formare o rimuovere un doppio legame all'interno di una molecola. Le isomerasi cambiano la posizione dei gruppi funzionali in modo che il substrato e il prodotto siano isomeri l'uno dell'altro, nel senso che contengono lo stesso numero di atomi. Infine, le ligasi catalizzano le reazioni chimiche attraverso la rimozione di una molecola d'acqua per creare singoli legami.
