Alcune differenze tra alghe e funghi sono che appartengono a regni tassonomici diversi e ottengono energia attraverso diverse fonti. Le alghe sono organismi simili a piante che appartengono al regno Protista, mentre i funghi appartengono al regno Fungi. Un'altra differenza sono gli ambienti in cui questi organismi possono vivere.
Le alghe sono organismi fotosintetici che hanno clorofilla e possono fare il loro cibo. Le alghe vivono principalmente in ambienti acquatici e hanno bisogno della luce del sole per sopravvivere. Le alghe possono includere diversi tipi di organismi, come alghe verdi, diatomee e dinoflagellati.
D'altro canto, i funghi sono dei decompositori che sopravvivono consumando materia morta o mangiando altri organismi, che sono i loro ospiti. Poiché i funghi non hanno clorofilla, questi organismi non possono produrre cibo come fanno le alghe. Sono eterotrofi, mentre le alghe sono autotrofi. I funghi vivono nel terreno, nell'aria e nell'acqua e possono prosperare sia alla luce del sole che all'oscurità. Alcuni tipi di funghi sono funghi, muffe e lievito.