Le cellule endoteliali e le cellule mesoteliali differiscono in sede. L'endotelio allinea i vasi sanguigni e altri vasi a forma di tubo, mentre il mesotelio copre la superficie esterna degli organi, secondo l'Histology Learning Center della Boston University.
Entrambe queste semplici cellule epiteliali squamose sono responsabili del rivestimento di superfici libere. Le cellule endoteliali e le cellule del mesotelio differiscono anche nella concentrazione del citoplasma. Le cellule endoteliali di solito presentano un citoplasma tra meno nuclei presente tra i nuclei. Le cellule mesoteliali tendono ad avere molto più citoplasma tra le strutture.
L'endotelio ha un contatto diretto con sangue e linfa. Le cellule endoteliali hanno un nucleo centrale e giacciono su una membrana fibrosa seminterrata. La struttura dell'endotelio coinvolge più celle sovrapposte per impedire fuoriuscite dalla nave. L'endotelio può essere ulteriormente suddiviso in endotelio continuo, fenestrato e discontinuo. L'endotelio localizzato nei vasi linfatici agisce contro l'infezione drenando il liquido interstiziale dalle cellule e dai tessuti.
Il mesotelio forma una copertura protettiva attorno a molti organi vitali. Il mesotelio è associato a cavità corporee interne, non a sangue e linfa. Come l'endotelio, il mesotelio ha un nucleo centrale e giace su una membrana basale. Le cellule mesoteliali sono suddivise in diversi tipi in base alla posizione e all'associazione di organi. Sia l'endotelio che il mesotelio sono spessi a strato singolo e derivano dallo strato mesodermico dell'embrione.
