La funzione primaria del midollo allungato è controllare le funzioni autonome in tutto il corpo. Controlla cose come battito cardiaco, respirazione e digestione.
Il midollo allungato invia segnali al midollo spinale e al talamo per controllare le funzioni corporee. È responsabile della respirazione e della circolazione in tutto il corpo e gestisce tutto, dalla respirazione al vomito.
Diverse arterie come l'arteria spinale anteriore e l'arteria cerebellare inferiore posteriore forniscono questa parte del cervello con un flusso costante di sangue. Contiene fibre nervose mielinizzate e non mielinizzate, chiamate anche materia bianca e grigia.
Considerando i compiti che il midollo allungato è responsabile, è facilmente la parte più importante del cervello. Qualsiasi lesione o malattia che colpisca questa parte del cervello può provocare paralisi del lato opposto del corpo, perdita di dolore e sensazioni termiche, perdita del riflesso del vomito e difficoltà a deglutire.
Il midollo allungato è anche responsabile del controllo dell'eccitazione e del sonno e controlla il movimento. Si trova alla base del tronco cerebrale insieme al mesencefalo e al ponte. Altre aree del tronco cerebrale controllano altre funzioni, come i nervi facciali e cranici, e aiutano a trasmettere i segnali dal cervello ad altri nervi nel corpo, principalmente il midollo spinale.