I funghi sono strutturati in filamenti chiamati ife, costituiti da stringhe di cellule e separati l'uno dall'altro da setti o traversi. Molte di queste ife raggruppate formano il micelio.
I setti, o traverse, tra ciascun filamento sono pieni di pori, consentendo il flusso e il trasporto di sostanze nutritive attraverso il fungo. Sebbene la maggior parte dei funghi siano costituiti da filamenti di ife che formano una struttura di micelio, le ife cenocitiche sono nette separate da pareti.
Una cellula fungina è costituita da un nucleo e da organelli. Come le piante, le cellule dei funghi sono circondate da pareti cellulari, ma le pareti cellulari non hanno cloroplasti, che sono le unità in cui avviene la fotosintesi, perché i funghi non producono cibo dal sole. Le pareti cellulari sono composte da quattro componenti: chitina, glucani, proteine e melanina. La chitina è costituita da fili di zucchero legati insieme per formare un motivo forte nel muro. I glucani sono anche costituiti da zucchero legato, ma hanno una forma più flessibile. La melanina aiuta a rafforzare la parete cellulare e protegge il fungo dai danni del sole. Alcune proteine mantengono l'acqua all'interno delle cellule, proteggendo il fungo dalla disidratazione.