I funghi saprofizzici assorbono i nutrienti dalla sostanza organica in decomposizione. Rilasciano acidi ed enzimi che rompono i tessuti morti in particelle più piccole in modo che possano essere assorbite. Questi funghi sono estremamente importanti per la catena alimentare perché aiutano a riciclare la materia morta nel terreno.
Il comportamento saprotrofico è uno dei quattro modi in cui i funghi ottengono i nutrienti. I funghi micorrizici formano relazioni simbiotiche con altre piante e animali. Di solito, la relazione è mutualistica, il che significa che entrambi gli organismi ne beneficiano. Il fungo si avvolge attorno alle cellule radice della pianta o avvolge le radici stesse. Il fungo fornisce ulteriore umidità e sostanze nutritive alla pianta e, a sua volta, ottiene l'accesso agli zuccheri prodotti dalla pianta. Anche i funghi endofiti formano una relazione mutualistica con una pianta ospite. Tuttavia, hanno una loro categoria perché, a differenza dei funghi myorrhizal, possono essere facilmente coltivati in un laboratorio senza una pianta ospite presente. I funghi parassiti infettano e si nutrono di organismi viventi, uccidendoli alla fine.
