La principale differenza tra materia organica e inorganica è che i composti organici contengono legami di carbonio e carbonio-idrogeno, mentre la maggior parte dei composti inorganici non contengono carbonio. I composti organici sono prodotti da e sono associati agli organismi viventi. I composti inorganici sono creati da processi naturali non viventi o dall'intervento umano.
Un'altra differenza tra i composti organici e inorganici è che la sostanza organica brucerà, ma la materia inorganica non brucerà. La materia organica si trova negli organismi viventi, o viventi una volta, quindi è di natura biologica. La materia inorganica è generalmente ottenuta dalla materia non vivente, quindi è di natura minerale. I composti inorganici sono meno complessi dei composti organici. La presenza di carbonio impedisce ai composti organici di formare sali. I composti inorganici possono formare sali e sono facilmente solubili in acqua.
La materia organica ha un tasso di reazione più lento rispetto alla materia inorganica. La velocità di reazione più lenta consente la formazione di prodotti più complessi durante la reazione. Quando immersi in una soluzione acquosa, i composti inorganici sono migliori conduttori di calore ed elettricità rispetto ai composti organici. La materia organica ha punti di fusione e di ebollizione più bassi rispetto alla materia inorganica. Principalmente legami ionici si formano in materia inorganica, mentre i legami covalenti sono presenti in materia organica. Benzina, urea, metano e fertilizzanti sono esempi comuni di materia organica. Acqua pura, aria, minerali e metalli sono alcuni esempi di materia inorganica.
