Flagella aiuta i corpi cellulari, come spermatozoi e batteri, a muoversi attraverso il liquido. Flagelli, come le ciglia, sono composti da microtubuli che sono collegati alla membrana plasmatica.
I microtubuli in un flagello sono raggruppati in nove coppie che circondano un paio di microtubuli. Il movimento dei flagelli è il risultato dei microtubuli che scivolano l'uno contro l'altro. Il filamento, situato all'estremità del flagello, è attaccato al gancio ed è composto da flagellina. Il movimento del filamento dipende dal movimento del motore collegato al gancio. Il corpo basale o il motore, che è prodotto dai centrioli, può muoversi fino a 300 giri al secondo.
Nei batteri, il flagello consente al corpo batterico di muoversi su o giù in linea retta e cambiare direzione. Il corpo basale che si attacca al corpo cellulare influenza la disposizione della struttura del filamento. Il filamento è a forma di elica, ma le proteine flagelliniche si riorganizzano se viene applicata o rimossa la coppia dal motore. Alcuni corpi cellulari con flagelli sono in grado di muoversi attraverso i tessuti, creando problemi per la linfa o il sistema circolatorio. I flagelli si trovano spesso singolarmente o in piccoli numeri, mentre molte ciglia si trovano insieme.
