Diversi tipi di animali mangiano pipistrelli come parte della loro dieta, tra cui gufi, falchi, serpenti e ragni. Anche se i pipistrelli hanno molti predatori, ci sono solo un paio che usano i pipistrelli come unica fonte di cibo .
I tipi di animali che mangiano i pipistrelli variano in base alla posizione e alle dimensioni del pipistrello. Oltre agli animali selvatici, i pipistrelli affrontano una minaccia significativa nella forma del gatto domestico comune, che è l'unico animale in grado di stare seduto su un tetto e di afferrare un pipistrello in aria.
Sebbene molti animali cacciano i pipistrelli per il cibo, gli umani sono i più grandi assassini di pipistrelli. Molte persone li considerano parassiti e non li vogliono nelle loro case e nei loro cantieri.