I molti tipi di animali che chiamano la casa del Rio delle Amazzoni sono il delfino del Rio delle Amazzoni, la lontra marina gigante, il piranha, il lamantino amazzone, la tartaruga gigante del Rio delle Amazzoni e l'anguilla elettrica, tra molti altri. Il Rio delle Amazzoni serve come dimora per oltre 2.500 specie di pesci, insieme a numerosi altri mammiferi, anfibi, serpenti e piante. Il Rio delle Amazzoni si classifica come il più lungo del mondo e vanta la più grande biodiversità di tutti i fiumi globali.
Il Rio delle Amazzoni contiene alcune specie famose, come i suoi delfini, insieme agli organismi meno conosciuti e quelli in attesa di classificazione. Alcune creature amazzoniche classificano come in via di estinzione o vulnerabili, come il delfino del Rio delle Amazzoni. Questo delfino, chiamato anche il delfino rosa, sopravvive solo negli habitat di acqua dolce. I delfini rosa vivono negli affluenti e negli estuari di molte nazioni amazzoniche, tra cui l'Ecuador, il Brasile e il Perù. La lontra di fiume gigante, una specie in via di estinzione, si basa su una dieta a base di pesce. Queste lontre raggiungono fino a sei piedi da adulti e pesano oltre 200 chili. Affrontano minacce da diverse fonti, tra cui il commercio di pellicce e la perdita dell'habitat. I piranha, tra le specie di pesci più feroci, godono di un aspetto distinto, grazie ai loro occhi rossi brillanti e ai lunghi denti aguzzi. Solo poche specie di questi pesci rappresentano una minaccia per l'uomo. Servono ruoli importanti nell'ecosistema amazzonico, nutrendosi di piante morte e animali e materia animale.